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Journals(Abstract)

基于生物信息学分析及功能实验探究TAF3在肝细胞癌中的作用机制

陈 娜1,2 邱家丽1 李 祎1 冯 湛1 王政禄1,2 *

1.天津市第一中心医院生物样本资源共享中心;2.南开大学移植医学研究院

摘要(Abstract):

目的 通过生物信息学分析及分子细胞生物学实验,探究TAF3在肝细胞癌(LIHC)中的表达特征、对肿瘤细胞增殖的影响及其调控免疫微环境的机制,为肝癌的诊断和治疗提供新靶点。方法 利用TCGA、GEO数据库分析TAF3在泛癌及肝癌组织中的表达差异,及其与患者临床分期(TNM 分期)、总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)的相关性。构建 TAF3 过表达及敲低的 Hep-G2细胞系,通过CCK-8法、克隆形成实验验证TAF3对肝癌细胞增殖和克隆形成能力的影响。对敲低TAF3的Hep-G2细胞 进行转录组测序,通过KEGG和GO分析筛选差异表达基因富集的信号通路。利用CIBERSORT和TIMER数据库,分析TAF3表达 与肝癌组织中免疫细胞(巨噬细胞、中性粒细胞、CD4+ /CD8+ T 细胞等)浸润水平的相关性。结果 TAF3在肝癌组织中显著高表 达(P<0.05),其表达水平与肿瘤患者TNM分期等呈正相关,TAF3高表达患者的OS和PFS显著缩短(HR=2.2,P=1.9×10-5 ;HR= 1.4,P=0.028)。TAF3 表达与 MKI67、PCNA、CDK4/6 呈强正相关(cor=0.27~0.72,P<0.001)。功能试验发现,过表达 TAF3显著增强Hep-G2细胞的增殖能力及克隆形成效率(P<0.05),敲低TAF3则抑制细胞增殖。此外,敲低TAF3后,类固醇生 物合成通路(LSS、CYP24A1 等基因)和补体及凝血级联反应通路(CEL、FGA/B/G 等基因)显著富集,表明TAF3参与调控类固醇代谢稳态及炎症微环境。进一步分析发现,TAF3表达与巨噬细胞(r=0.495,P=1.62×10-22)、中性粒细胞(r=0.529,P=2.70× 10-26)等免疫细胞浸润水平呈强正相关,并与CD4+ /CD8+ T细胞、树突状细胞存在复杂互作关系。结论 TAF3在肝癌中高表达,可通过调控细胞增殖信号通路、干扰类固醇代谢稳态及重塑免疫微环境(如促进巨噬细胞和中性粒细胞浸润)驱动肿瘤进展。其 表达水平可作为肝癌预后评估的潜在生物标志物,靶向TAF3或其调控的信号通路(如类固醇代谢轴、补体级联反应)有望为肝癌的精准治疗提供新策略。


关键词(KeyWords):

TAF3;肝细胞癌;生信分析;细胞增殖;免疫细胞浸润


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