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Journals(Abstract)

基于网络药理学与分子对接探讨黄芪-丹参药对干预心肌纤维化的作用机制研究

陈景和

中国中医科学院西苑医院心血管科

摘要(Abstract):

目的:基于网络药理学与分子对接技术,系统挖掘黄芪-丹参药对干预心肌纤维化的核心活性成分、潜在作用靶点及关键信号通路,明确其“多成分、多靶点、多通路”的协同作用机制,为该中药药对临床治疗心肌纤维化提供科学的理论依据与实验参考。方法:通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选黄芪、丹参的活性成分,设定口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为筛选标准,结合Uniprot数据库校正活性成分对应的人类靶点;利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库收集心肌纤维化相关靶点,通过Venny2.1.0工具获取黄芪-丹参药对活性成分靶点与心肌纤维化靶点的交集,即潜在作用靶点。运用Cytoscape3.9.1软件构建“黄芪-丹参活性成分-潜在作用靶点-心肌纤维化”网络,分析网络拓扑结构筛选核心成分与核心靶点;借助STRING平台构建核心靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用DAVID6.8数据库对潜在作用靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。选取核心活性成分与核心靶点,利用AutoDockVina软件进行分子对接验证,通过PyMOL软件可视化对接结果,分析两者结合模式与相互作用力。结果:共筛选出黄芪-丹参药对活性成分42个,其中核心活性成分包括黄芪甲苷、丹酚酸B、丹参酮ⅡA等;获取潜在作用靶点136个,核心靶点包括TP53、AKT1、VEGFA、IL-6、TNF等。GO功能富集分析显示,潜在作用靶点主要参与细胞增殖、炎症反应、氧化应激、细胞凋亡调控等生物学过程;KEGG通路富集分析表明,其主要富集于TGF-β/Smad信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等与心肌纤维化密切相关的通路。分子对接结果显示,核心活性成分与核心靶点均具有良好的结合能力,其中丹酚酸B与TP53、黄芪甲苷与AKT1的对接得分分别为-8.9kcal/mol、-8.7kcal/mol,结合模式稳定,主要通过氢键、疏水作用实现紧密结合。结论:黄芪-丹参药对可能通过其核心活性成分,靶向结合TP53、AKT1等核心靶点,调控TGF-β/Smad、PI3K-Akt等关键信号通路,协同发挥抑制心肌成纤维细胞增殖、减轻炎症反应、抑制氧化应激、减少细胞外基质沉积等作用,从而实现对心肌纤维化的干预效果,该研究为阐释其作用机制提供了理论支撑,也为其临床合理应用及后续实验研究奠定了基础。


关键词(KeyWords):

网络药理学;分子对接;黄芪-丹参药对;心肌纤维化;作用机制;信号通路


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